服務(wù)編號:BIOLY001
服務(wù)簡介
Label-free定量蛋白質(zhì)組學是一種無需同位素標記,直接通過質(zhì)譜信號強度(如肽段母離子強度或譜圖計數(shù))進行相對定量的強大技術(shù)。該方法簡化了實驗流程,降低了成本,特別適合復雜樣本、大規(guī)模隊列研究或難以標記樣本的蛋白質(zhì)組深度分析。其核心在于高分辨率、高靈敏度的質(zhì)譜儀和強大的生物信息學分析能力。
百歐泰采用國際領(lǐng)先的timsTOF Pro 2質(zhì)譜平臺,將Label-free定量技術(shù)帶入4D新時代。在傳統(tǒng)三維數(shù)據(jù)(保留時間、質(zhì)荷比、離子強度)的基礎(chǔ)上,timsTOF Pro 2創(chuàng)新性地引入了離子淌度(Ion Mobility Spectrometry, IMS) 作為第四維分離維度。離子淌度根據(jù)離子在電場中與緩沖氣體碰撞時的形狀(碰撞截面積,CCS)進行分離,顯著提高了復雜樣本中肽段的分辨率、檢測靈敏度和定量準確性。
技術(shù)原理
timsTOF Pro 2 的核心創(chuàng)新在于其雙TIMS(捕集離子淌度分離)技術(shù):
1.離子累積與分離并行化:離子在第一個TIMS裝置中進行累積。
2.淌度分離:累積的離子被傳輸?shù)降诙€TIMS裝置中,根據(jù)其淌度(碰撞截面積,CCS)進行高效分離。
3.高效碎裂:經(jīng)過淌度分離后的離子進入高靈敏度TOF質(zhì)量分析器進行MS/MS碎裂。
4.近乎100%占空比:當?shù)诙€TIMS正在進行淌度分離和后續(xù)MS/MS分析時,第一個TIMS已經(jīng)在平行地累積下一批離子。這種“并行操作”模式實現(xiàn)了近乎100%的離子利用率,大幅提升了檢測靈敏度和掃描速度,特別適合復雜生物樣本的深度覆蓋和準確定量。
分析流程
樣品要求
客戶提供 | 要求 |
細胞/組織裂解液 | 提供總蛋白量 ≥ 100 μg (推薦 ≥ 200 μg),濃度 ≥ 1 μg/μL。溶解于兼容質(zhì)譜的裂解液(如SDC或RapiGest),避免使用高濃度去垢劑(如SDS)、鹽分(如NaCl, EDTA, Tris)、甘油、核酸等干擾物。樣本需干冰寄送。 |
體液(血清/血漿) | 提供體積 ≥ 50 μL (推薦 ≥ 100 μL)。需明確處理方法(如高豐度蛋白去除)。避免溶血。樣本需干冰寄送。 |
蛋白溶液 | 提供總蛋白量 ≥ 100 μg (推薦 ≥ 200 μg),濃度 ≥ 1 μg/μL。緩沖液要求同上。樣本需干冰寄送。 |
SDS-PAGE膠條/點 | 提供足量膠條,需明確目標條帶/點位置。干冰寄送。 |
服務(wù)優(yōu)勢
1.無標記,更靈活:無需同位素標記,實驗設(shè)計更簡單,成本更低,適用于幾乎所有生物樣本類型(細胞、組織、體液、FFPE等)。
2.4D分離,深度覆蓋: 基于timsTOF Pro 2的4D(保留時間、質(zhì)荷比、離子強度、離子淌度)分離技術(shù),顯著提升復雜樣本中低豐度肽段的分離能力和檢測靈敏度,實現(xiàn)更深度的蛋白質(zhì)組覆蓋。
3.超高靈敏度與速度: 雙TIMS設(shè)計實現(xiàn)近乎100%離子利用率,配合高掃描速度,可在單針分析中鑒定和定量數(shù)千種蛋白質(zhì)。
4.高定量準確性: 離子淌度分離有效降低背景干擾,提高譜圖質(zhì)量,結(jié)合先進的定量算法(如MaxQuant, Spectronaut, DIA-NN),確保定量的穩(wěn)定性和重復性。
5.強大的生信分析: 提供從原始數(shù)據(jù)到生物學洞見的完整分析流程,包括嚴格質(zhì)控、深度定性定量、差異分析、功能注釋(GO, KEGG, COG, 結(jié)構(gòu)域)、互作網(wǎng)絡(luò)、多組學關(guān)聯(lián)等。
經(jīng)驗豐富的團隊: 擁有資深蛋白質(zhì)組學專家和技術(shù)人員,確保實驗操作規(guī)范、數(shù)據(jù)分析精準可靠。
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